Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN21Q16825 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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