Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms