Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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