Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHHQ15465 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHHQ15465 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHHQ15465 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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