| RUNX2 | Q13950 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEUP1-201 | ENST00000298050 | 2664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGAP11A-207 | ENST00000565905 | 3318 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00836-202 | ENST00000626230 | 1640 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SACS-201 | ENST00000382292 | 15324 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | E2F5-208 | ENST00000521429 | 1551 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GLMN-201 | ENST00000370360 | 1995 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-15P-201 | ENST00000362613 | 141 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-595P-201 | ENST00000363944 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.315-201 | ENST00000365117 | 102 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA41-201 | ENST00000384675 | 132 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR9-1-201 | ENST00000385198 | 89 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD88.1-201 | ENST00000408684 | 91 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC236972.2-201 | ENST00000434979 | 310 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591501.1-201 | ENST00000439992 | 495 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011816.1-201 | ENST00000441346 | 546 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD109B-201 | ENST00000458961 | 67 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD109A-201 | ENST00000459128 | 67 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073901.1-201 | ENST00000462471 | 408 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090515.1-201 | ENST00000465295 | 476 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC140059.1-201 | ENST00000489238 | 361 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP75-201 | ENST00000491601 | 451 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021146.2-201 | ENST00000504736 | 556 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02386-203 | ENST00000552182 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021231.3-201 | ENST00000558497 | 370 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3136-201 | ENST00000583498 | 78 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP88-201 | ENST00000605759 | 454 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5739-201 | ENST00000619803 | 80 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC242426.3-202 | ENST00000607149 | 2397 nt | TSL 5 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VTRNA1-1-201 | ENST00000363120 | 99 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.813-201 | ENST00000364639 | 102 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.579-201 | ENST00000390939 | 94 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P27-201 | ENST00000420740 | 428 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356010.2-201 | ENST00000422844 | 197 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093083.1-201 | ENST00000438633 | 347 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108938.1-201 | ENST00000451204 | 136 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099520.1-202 | ENST00000503650 | 777 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP94-201 | ENST00000512518 | 302 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021491.3-201 | ENST00000513378 | 156 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP356-201 | ENST00000515972 | 94 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC17P-201 | ENST00000517272 | 120 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105999.1-201 | ENST00000518722 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007375.1-201 | ENST00000554513 | 578 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022809.1-201 | ENST00000579247 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA4-201 | ENST00000629045 | 128 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CFH-202 | ENST00000367429 | 4127 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC233981.2-201 | ENST00000611524 | 1614 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5V1-217 | ENST00000641768 | 2763 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM232-201 | ENST00000455884 | 2501 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FGF7-202 | ENST00000560270 | 1688 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | COMMD6-201 | ENST00000355801 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.187-201 | ENST00000363918 | 113 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-142P-201 | ENST00000384019 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1032P-201 | ENST00000384100 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR559-201 | ENST00000385188 | 96 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP201-201 | ENST00000410316 | 124 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353997.1-201 | ENST00000432936 | 108 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097662.1-205 | ENST00000433324 | 241 nt | TSL 5 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005154.1-208 | ENST00000440438 | 353 nt | TSL 5 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS3P1-201 | ENST00000456781 | 192 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU13.6-201 | ENST00000458785 | 104 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105389.2-201 | ENST00000506475 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAR1B-211 | ENST00000509937 | 455 nt | TSL 5 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093303.1-201 | ENST00000514549 | 295 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC7P-201 | ENST00000516280 | 125 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4635-201 | ENST00000583759 | 79 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNRD1-AS1_2.5-201 | ENST00000614729 | 76 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMAD5-AS1_4.1-201 | ENST00000615561 | 167 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160413.1-201 | ENST00000622780 | 310 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TANK-201 | ENST00000259075 | 2152 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AKAP9-202 | ENST00000358100 | 10309 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU2_19.1-201 | ENST00000362361 | 80 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-109P-201 | ENST00000383960 | 147 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139095.1-201 | ENST00000404326 | 391 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006150.1-201 | ENST00000412014 | 263 nt | TSL 5 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012306.1-201 | ENST00000423267 | 114 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC133865.1-201 | ENST00000438619 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359853.2-201 | ENST00000442108 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354949.1-201 | ENST00000446438 | 170 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP2C59P-201 | ENST00000457790 | 269 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087477.1-201 | ENST00000465747 | 340 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL30P10-201 | ENST00000488148 | 337 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN1P13-201 | ENST00000505795 | 138 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02118-202 | ENST00000510583 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023866.1-201 | ENST00000518064 | 579 nt | TSL 4 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4319-201 | ENST00000577285 | 85 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005899.2-201 | ENST00000584353 | 90 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LUZP6-201 | ENST00000589735 | 177 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023043.3-201 | ENST00000593113 | 385 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138963.2-201 | ENST00000605137 | 226 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589935.1-202 | ENST00000612512 | 393 nt | TSL 5 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022140.2-201 | ENST00000623500 | 188 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP57L1-216 | ENST00000521522 | 2259 nt | TSL 5 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD18EP-201 | ENST00000405487 | 2632 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAB2-201 | ENST00000367456 | 4553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1115P-201 | ENST00000362490 | 106 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |