Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX2Q13950 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX2Q13950 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RUNX2Q13950 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms