Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CALCOCO2Q13137 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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