Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXA3O43365 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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