Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP6Q16828 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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