Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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