Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CTTNQ14247 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms