Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms