Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SRSF6Q13247 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms