Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NME3Q13232 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NME3Q13232 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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