Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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