Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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CNTN1Q12860 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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