Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrit3W8DXL4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms