Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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