Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms