Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms