Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tulp1Q9Z273 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms