Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms