Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms