Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms