Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setbp1Q9Z180 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setbp1Q9Z180 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setbp1Q9Z180 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setbp1Q9Z180 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Setbp1Q9Z180 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Setbp1Q9Z180 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setbp1Q9Z180 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setbp1Q9Z180 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms