Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sumo3Q9Z172 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms