Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rspo1Q9Z132 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rspo1Q9Z132 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms