Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn9Q9Z0S7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms