Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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