Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn2Q9Z0I6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn2Q9Z0I6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn2Q9Z0I6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn2Q9Z0I6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn2Q9Z0I6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn2Q9Z0I6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn2Q9Z0I6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms