Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srd5a3Q9WUP4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms