Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnn1gQ9WU39 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms