Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms