Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a4Q9QZR9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Col4a4Q9QZR9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Col4a4Q9QZR9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a4Q9QZR9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Col4a4Q9QZR9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Col4a4Q9QZR9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Col4a4Q9QZR9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a4Q9QZR9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Col4a4Q9QZR9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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