Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Npas3Q9QZQ0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Npas3Q9QZQ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Npas3Q9QZQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Npas3Q9QZQ0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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