Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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