Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmlQ9QZD5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms