Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms