Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms