Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms