Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacl1Q9QXE0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 484.5 ms