Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms