Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms