Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hdgfl3Q9JMG7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms