Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms