Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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