Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms