Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms