Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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