Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms