Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms